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肠道菌群测序数据 16S rRNA测序队列 和 宏基因组学测序队列可以合并吗？

奥利奥星冰乐 发表于 2022-10-29 16:09:51 | 显示全部楼层 |阅读模式
求助，本人正在学习分析肠道微生物测序数据，导师给了一个病例-对照研究的数据，但肠道菌群测序数据不是用同一个方法测的，前100人（40病例:60对照）是用了16S rRNA，后80人（20病例:60对照）是测了宏基因组学。
我知道处理原始测序数据，16S rRNA测序和宏基因组学测序的方法和步骤不同，但是我想请问

          在处理好测序原始数据之后，菌群聚类成功后，这40名和20名病例可以看成是一个病例组（60人），60名和60名对照可以看成是一个对照组（120人）吗？

谢谢！祝各位科研顺利，成果累累！
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